MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4726

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014134	AAT	2	6	1	6	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014134	A	7	7	14	20	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014134	ATT	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014134	TAAA	2	8	58	65	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014134	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014134	ATT	2	6	119	124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014134	A	6	6	1574	1579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014134	AAC	2	6	1610	1615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014134	T	6	6	2580	2585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014134	TAA	2	6	2606	2611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014134	T	6	6	2642	2647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014134	ATA	2	6	2651	2656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014134	T	6	6	2699	2704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014134	TTA	2	6	3104	3109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014134	A	6	6	3154	3159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014134	T	8	8	3180	3187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014134	GA	3	6	3188	3193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014134	GA	3	6	3200	3205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014134	TGA	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014134	GA	3	6	3230	3235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014134	AAT	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014134	TTA	2	6	3312	3317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014134	T	7	7	3322	3328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014134	TCA	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014134	ATAG	2	8	3344	3351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014134	TTA	2	6	3368	3373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014134	CTTT	2	8	3412	3419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014134	TTG	2	6	3618	3623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014134	TAA	2	6	3654	3659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014134	AAT	2	6	3664	3669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014134	T	6	6	3745	3750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014134	CCA	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014134	GT	3	6	3808	3813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014134	TTG	2	6	3857	3862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014134	TG	3	6	3874	3879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014134	CA	3	6	3882	3887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014134	TTTG	2	8	3919	3926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014134	TGA	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014134	AACA	2	8	3997	4004	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014134	AGA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014134	ATT	2	6	4038	4043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014134	CAA	2	6	4052	4057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014134	T	7	7	4261	4267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014134	TAAAA	2	10	4269	4278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014134	TCG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014134	AT	3	6	4343	4348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014134	GTTT	2	8	4362	4369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014134	AAT	2	6	4404	4409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014134	ATG	2	6	4419	4424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014134	TAT	2	6	4452	4457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014134	CAT	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014134	CTA	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014134	TA	3	6	6714	6719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014134	ATTT	2	8	6720	6727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014134	GGA	2	6	7536	7541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014134	ATG	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014134	GCG	2	6	8361	8366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014134	ATT	2	6	8376	8381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014134	CAA	2	6	8438	8443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014134	GC	3	6	8445	8450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014134	TGA	2	6	8488	8493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014134	GAC	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014134	CAA	2	6	8517	8522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014134	CAAT	2	8	8530	8537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014134	GT	3	6	8572	8577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014134	AAC	2	6	8687	8692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014134	A	8	8	8705	8712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014134	CTGG	2	8	8722	8729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014134	A	6	6	8752	8757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014134	A	6	6	8768	8773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014134	AAT	2	6	8862	8867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014134	T	6	6	8935	8940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014134	TA	3	6	8943	8948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014134	CAC	2	6	8959	8964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014134	GA	3	6	8966	8971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014134	A	7	7	9475	9481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014134	ATT	2	6	9544	9549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014134	CTT	3	9	9576	9584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014134	CAG	2	6	9603	9608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014134	AAT	2	6	9649	9654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014134	CTG	2	6	9803	9808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014134	A	6	6	9811	9816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014134	T	6	6	9820	9825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014134	ATT	2	6	9926	9931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014134	ACAA	2	8	9939	9946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014134	AAAC	2	8	10051	10058	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014134	AAT	2	6	10885	10890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014134	AATG	2	8	10927	10934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014134	ATT	2	6	10939	10944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014134	A	6	6	10992	10997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014134	CAT	2	6	11008	11013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014134	TAT	2	6	12709	12714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014134	A	7	7	12725	12731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014134	TA	3	6	12795	12800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014134	AGTG	2	8	12830	12837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014134	AATT	2	8	12895	12902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014134	T	7	7	12932	12938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014134	ACC	2	6	13362	13367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014134	TAATTT	2	12	13370	13381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014134	TCA	2	6	13423	13428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014134	T	7	7	13504	13510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014134	TAA	2	6	13796	13801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014134	TTA	2	6	13802	13807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014134	AGG	2	6	13818	13823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014134	GGA	2	6	14417	14422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014134	TAAA	2	8	14977	14984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014134	T	7	7	15022	15028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014134	ATT	2	6	15068	15073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014134	CTC	2	6	15091	15096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_014134	TAG	2	6	15112	15117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014134	T	6	6	15986	15991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014134	AAG	2	6	16313	16318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014134	TAA	2	6	16371	16376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014134	ACTGA	2	10	16410	16419	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014134	AT	3	6	16424	16429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014134	TTAAT	2	10	16469	16478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014134	TA	3	6	17083	17088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014134	ACT	2	6	17123	17128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014134	TAA	2	6	17145	17150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014134	T	7	7	17167	17173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014134	CAAG	2	8	17206	17213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014134	TGG	2	6	17222	17227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014134	TTG	2	6	17254	17259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014134	GTT	2	6	17334	17339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014134	AGT	2	6	17351	17356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014134	ACT	2	6	17360	17365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014134	A	6	6	17385	17390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014134	TTA	2	6	17456	17461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014134	AAC	2	6	17469	17474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014134	TTTATA	2	12	17535	17546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014134	ATT	2	6	17573	17578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014134	TTTA	2	8	17606	17613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014134	A	7	7	17898	17904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014134	TTTG	2	8	17930	17937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014134	ACTGA	2	10	17973	17982	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014134	GTA	2	6	18010	18015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014134	ATG	2	6	18053	18058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014134	ATT	2	6	18069	18074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014134	AAATAT	2	12	18114	18125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014134	ATAC	2	8	18976	18983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014134	AT	3	6	19027	19032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014134	TGT	2	6	19079	19084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014134	AATTA	2	10	20686	20695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014134	AAT	2	6	20706	20711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014134	T	6	6	20725	20730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014134	AAT	2	6	20734	20739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014134	TGAG	2	8	20808	20815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014134	AAG	2	6	20873	20878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014134	ATG	2	6	20888	20893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014134	T	7	7	20926	20932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014134	TA	3	6	20961	20966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014134	T	6	6	20971	20976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014134	TAA	2	6	20979	20984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014134	A	6	6	20983	20988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014134	T	7	7	20994	21000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014134	AAT	2	6	21051	21056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014134	AT	3	6	21055	21060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014134	ATTTG	2	10	21067	21076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014134	AAT	2	6	21077	21082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014134	TTAAT	2	10	21103	21112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014134	T	6	6	21162	21167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014134	ATTTT	2	10	23609	23618	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014134	GTG	2	6	23671	23676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014134	ATT	2	6	23688	23693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014134	ATT	2	6	23734	23739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014134	AGG	2	6	23791	23796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014134	ATTT	2	8	24271	24278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014134	T	8	8	24298	24305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014134	GAG	2	6	24314	24319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014134	ATG	2	6	24322	24327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014134	A	6	6	24328	24333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014134	AGA	2	6	24338	24343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014134	ATA	2	6	24370	24375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014134	ACT	2	6	24420	24425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_014134	ACC	2	6	24491	24496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
176	NC_014134	GCT	2	6	24502	24507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_014134	TGC	2	6	24579	24584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_014134	T	6	6	24693	24698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014134	A	7	7	25930	25936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014134	AT	3	6	25939	25944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_014134	TA	3	6	25948	25953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014134	TA	4	8	25980	25987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014134	AT	3	6	25989	25994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014134	TA	5	10	26106	26115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014134	AT	3	6	26158	26163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014134	TAT	2	6	26186	26191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014134	TAA	2	6	26203	26208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014134	A	6	6	26207	26212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014134	AAAAG	2	10	26217	26226	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
190	NC_014134	CCA	2	6	26227	26232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
191	NC_014134	TACA	2	8	26254	26261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_014134	TTTG	2	8	26267	26274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014134	TAT	2	6	26288	26293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_014134	ACA	2	6	26294	26299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_014134	TGT	2	6	26309	26314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NC_014134	A	6	6	26438	26443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014134	ACT	2	6	26468	26473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_014134	ACAA	2	8	26497	26504	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
199	NC_014134	GTA	2	6	26519	26524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
200	NC_014134	AATA	2	8	26611	26618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_014134	T	7	7	26644	26650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_014134	GTTT	2	8	26744	26751	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
204	NC_014134	T	7	7	26760	26766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_014134	ATT	2	6	27349	27354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_014134	T	6	6	27822	27827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_014134	AATG	2	8	29501	29508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_014134	ATTG	2	8	29570	29577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
252	NC_014134	TTG	2	6	29610	29615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.